Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nrf1Q9WU00 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nrf1Q9WU00 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms