Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp18Q9WTV6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms