Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcm1Q9R0L6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms