Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fhl3Q9R059 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms