Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms