Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Npas3Q9QZQ0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms