Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms