Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt3Q9QZ47 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt3Q9QZ47 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt3Q9QZ47 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt3Q9QZ47 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnt3Q9QZ47 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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