Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ15

Clec4a, C-type lectin domain family 4 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4aQ9QZ15 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clec4aQ9QZ15 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clec4aQ9QZ15 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms