Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Snai3Q9QY31 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snai3Q9QY31 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms