Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Opn4Q9QXZ9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Opn4Q9QXZ9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Opn4Q9QXZ9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Opn4Q9QXZ9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Opn4Q9QXZ9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms