Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcsk1nQ9QXV0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms