Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf3Q9QXK7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf3Q9QXK7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms