Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms