Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thsd1Q9JM61 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thsd1Q9JM61 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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