Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms