Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx20Q9JJY4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx20Q9JJY4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms