Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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