Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms