Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Bco1Q9JJS6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bco1Q9JJS6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Bco1Q9JJS6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Bco1Q9JJS6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Bco1Q9JJS6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bco1Q9JJS6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Bco1Q9JJS6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bco1Q9JJS6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bco1Q9JJS6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bco1Q9JJS6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Bco1Q9JJS6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Bco1Q9JJS6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bco1Q9JJS6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bco1Q9JJS6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bco1Q9JJS6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bco1Q9JJS6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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