Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Riox1Q9JJF3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Riox1Q9JJF3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Riox1Q9JJF3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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