Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccl28Q9JIL2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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