Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms