Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc4Q9ES56 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc4Q9ES56 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms