Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms