Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Barx1Q9ER42 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Barx1Q9ER42 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms