Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpsf1Q9EPU4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf1Q9EPU4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms