Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms