Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmg20aQ9DC33 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmg20aQ9DC33 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmg20aQ9DC33 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmg20aQ9DC33 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmg20aQ9DC33 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hmg20aQ9DC33 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hmg20aQ9DC33 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Hmg20aQ9DC33 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hmg20aQ9DC33 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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