Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms