Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tmem239Q9DA47 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tmem239Q9DA47 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms