Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp12Q9D9M2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp12Q9D9M2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms