Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms