Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms