Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2c55Q9D816 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms