Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms