Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Echdc3Q9D7J9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Echdc3Q9D7J9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Echdc3Q9D7J9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Echdc3Q9D7J9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Echdc3Q9D7J9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Echdc3Q9D7J9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Echdc3Q9D7J9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Echdc3Q9D7J9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Echdc3Q9D7J9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Echdc3Q9D7J9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Echdc3Q9D7J9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms