Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms