Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Borcs6Q9D6W8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Borcs6Q9D6W8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Borcs6Q9D6W8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Borcs6Q9D6W8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Borcs6Q9D6W8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Borcs6Q9D6W8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Borcs6Q9D6W8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Borcs6Q9D6W8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Borcs6Q9D6W8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Borcs6Q9D6W8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Borcs6Q9D6W8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms