Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt34Q9D646 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms