Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930449I24RikQ9D5E3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms