Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms