Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms