Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms