Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms