Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rufy3Q9D394 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms