Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vps28Q9D1C8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps28Q9D1C8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms