Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms