Protein–RNA interactions for Protein: Q9D030

Twist2, Twist-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist2Q9D030 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist2Q9D030 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms