Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Bud23Q9CY21 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Bud23Q9CY21 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bud23Q9CY21 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms